Astfel, DCU va fi condus de un comitet executiv compus din trei membri.

Totodată, Consiliul de supraveghere al DCU este format din reprezentanţi ai Băncii Naţionale a Moldovei, Comisiei Naţionale a Pieţei Financiare, Ministerului Finanţelor şi Bursei de Valori a Moldovei.

DCU este creat în baza Legii cu privire la Depozitarul central unic al valorilor mobiliare, adoptată în anul 2016, şi va fi singura instituţie din Republica Moldova care va desfăşura activităţi de evidenţă, depozitare şi decontare a valorilor mobiliare de stat şi corporative.